云南完成铁皮石斛基因精细图谱 将有力推动全省石斛产业发展
人民网普洱9月4日电9月4日,记者从云南省普洱市普洱茶研究院重大科技成果新闻通气会上获悉,云南农业大学联合普洱市普洱茶研究院,在中国科学院昆明动物研究所的技术支持下,用一年半时间,完成了铁皮石斛全基因组测序工作,绘制了铁皮石斛的全基因精细图谱。这是云南省主导完成的第一个植物基因组,同时也使铁皮石斛成为第一个进行全基因组测序的药食同用植物。
铁皮石斛是云南省极具特色的珍稀高端药用、食用植物。2012年底,云南石斛种植面积超过6万亩,产值已达到30亿元。2012年1月,在云南省科技厅的支持下,云南省成立了石斛产业技术创新战略联盟,并设立专项经费开展了云南铁皮石斛地理标志研究、云南铁皮石斛质量标准研究、云南省石斛科技产业发展规划以及铁皮石斛基因组计划等课题。
作为联盟成员单位的云南农业大学联合普洱市普洱茶研究院,在中国科学院昆明动物研究所的技术支持下,以云南农业大学盛军校长(普洱市副市长)、昆明动物研究所王文研究员为课题组组长,全面展开了云南铁皮石斛基因组计划的实施。在普洱茶研究院严亮博士和昆明动物研究所董扬博士(现为昆明理工大学生命科学与技术学院教授)、王筱硕士的全力协同工作下,使用目前最新的第二代测序技术和近期刚刚引入国内的第三代单分子测序技术,用一年半时间,完成了铁皮石斛全基因组测序工作,绘制了铁皮石斛的全基因精细图谱。目前,测序深度已达铁皮石斛基因组大小的200倍,测序结果已覆盖95%的全基因组和97%的基因编码区,超过国际上同行复杂基因测序的最高水平。研究组进一步解析了铁皮石斛基因组中的基因信息,发现了48200多个蛋白质编码基因,其基因数目是目前所有已经测序的植物中最多的,从基因水平证实了铁皮石斛基因组的复杂性。
铁皮石斛基因组精细图谱的绘制完成,标志着铁皮石斛研究进入基因时代,同时也开启了国际药食同用植物基因组研究的新纪元。铁皮石斛基因组精细图谱的完成,为云南省铁皮石斛行业标准制定奠定了基础,也为中国从基因水平分析和制定铁皮石斛标准提供了科学依据。铁皮石斛的基础研究和应用开发,必将进一步加快云南石斛产业的科学发展。
该项目发起人,云南农业大学校长、普洱市副市长盛军教授指出,铁皮石斛基因组的完成,将会改变铁皮石斛产业凭经验发展的现状,为品种鉴定、基因育种、成分和功能研究以及新产品开发提供基础数据,将持续推动云南石斛产业的可持续发展。该项目的另一负责人王文研究员认为,铁皮石斛基因组将为兰科植物的起源、演化和特性研究提供基础数据,作为第一个被解析的药食同用植物基因组,也将进一步提振中药的国际知名度,促进中草药的现代化。
据了解,普洱市人民政府对铁皮石斛基因组项目给予了大力支持,安排专项经费用于铁皮石斛全基因组测序研究。这也使普洱市成为了全国第一个支持基因组计划的地级市,展现了普洱生态立市、绿色发展的决心。
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